虫は基本的に乾季 ( 5月～11月 )には少なく、雨季 ( 12月～5月 ) に増えます。

蚊
年中います。といっても意外に少なく、日本の夏より少ないです。ホテルによっては蚊帳・蚊取りマット・蚊除けのオイルなどが用意されているところがありますので、気になる方はそれらを使うだけで十分安眠できると思います。
蚊除けオイルはコンビニでも売っています。
デング熱などの蚊による伝染病の話はときどき聞きますが、予防接種が必要なほど流行することはありません。

アリ
蚊よりも面倒なのが、実はアリです。こちらではいたるところに出没します。しかも何種類もいます…。食べ物は冷蔵庫以外に安全地帯はありません。シティホテルではアリ害はほとんどないと思いますが、土や木が近くにあるヴィラや民宿にお泊まりの方は食べ物・飲み物をテーブルの上などに長く放置しないほうがいいです。

ハエ
これも日本よりも多いです。特にローカル食堂では必ずいます。普通のレストランでもジャワ島のレストランは半オープンだったり、ドアや窓が開けっ放しになっていることが多いので時々入ってきます。避ける方法はないので、気になる方は、高級ホテルやショッピングモールのレストランをご利用ください。

ゴキブリ
日本と同じでいるところにはいます。こちらでも嫌われ者ですので、一般家庭でもどんなレベルのホテル・レストランでも対策はしています。

ヤモリ
虫ではありませんが、出没頻度が高いので合わせて紹介します。
木が多いところにあるホテルやレストランの天井や壁によくいます。こちらではヤモリは蚊を食べてくれる生き物なので、退治されることはありません。